IMGT, det internationella informationssystemet ImMunoGeneTics® (IMGT), inrättades 1989 för att kartlägga de gener och alleler som är involverade i syntesen av immunoglobuliner (IG, eller antikroppar) och T-cellreceptorer (TR) hos ryggradsdjur. IMGT® är en integrerad resurs för sekvenser, gener och strukturer hos IG, TR och proteiner inom den stora histokompatibilitetsfamiljen (MH) som är involverade i adaptiva immunreaktioner, samt andra proteiner från immunoglobulinsuperfamiljen (IgSF) och MH-superfamiljen (MhSF) hos ryggradsdjur och ryggradslösa djur. IMGT® omfattar 7 databaser, 17 onlineverktyg och över 20 000 webbsidor med resurser.

I detta sammanhang ingår praktiken i IMGT:s löpande utvecklingsarbete och kommer att omfatta utformningen av ett interaktivt verktyg för visualisering av nukleotidsekvenser, som ska underlätta utforskningen, annoteringen och förståelsen av immunogenetiska data.

Studentens huvuduppgift kommer att vara att skapa ett JavaScript-verktyg (som körs i webbläsaren i det ursprungliga gränssnittet) för att visualisera nukleotidsekvenser (med deras översättningar) och de nukleotidelement som de innehåller, utifrån en JSON-fil som innehåller dessa enheter.

Verktyget bör vara dynamiskt och göra det möjligt för användaren att ändra olika uppgifter om enheterna, spara dessa ändringar i JSON-filen och lägga till kommentarer.

Beroende på studentens kunskaper och intressen kan ytterligare visuella eller tekniska komponenter krävas, där JavaScript används som huvudsakligt programmeringsspråk och en JSON-fil som in- och utdataformat.