Borrelia burgdorferi BmpD is een substraatbindend eiwit (SBP) dat gebruikmaakt van een membraangebonden ABC-transportercomplex om moleculen naar het bacteriële cytoplasma te transporteren. Het doel van het project is het bestuderen van de bindingsinteracties en de dynamica van substraatbindende eiwitten en hun ABC-transporter. De student zou op zoek gaan naar experimentele structuren van SBP’s en ABC-transporters en die structuren die gelijkenis vertonen met de Borrelia-eiwitten gedetailleerd analyseren, met als doel de residuen te identificeren die bij de interacties betrokken zijn. Verder zou de dynamica van de interactie worden bestudeerd met behulp van moleculaire dynamicasimulaties.