Borrelia burgdorferi BmpD ist ein Substratbindungsprotein (SBP), das einen membrangebundenen ABC-Transporterkomplex nutzt, um Moleküle in das bakterielle Zytoplasma zu transportieren. Ziel des Projekts ist es, die Bindungswechselwirkungen und die Dynamik von Substratbindungsproteinen und ihrem ABC-Transporter zu untersuchen. Der Studierende würde nach experimentellen Strukturen von SBPs und ABC-Transportern suchen und diejenigen, die den Borrelia-Proteinen ähnlich sind, detailliert analysieren, um die an den Wechselwirkungen beteiligten Aminosäurereste zu identifizieren. Darüber hinaus würde die Dynamik der Wechselwirkung mithilfe von Molekulardynamik-Simulationen untersucht werden.
Hintergrundwissen in den Biowissenschaften auf dem Niveau eines Studierenden im 3. Jahr eines Bachelor- oder Masterstudiengangs, Grundkenntnisse über Proteinstrukturen, grundlegende Laborfertigkeiten.