Borrelia burgdorferi BmpD er et substratbindende protein (SBP) som bruker et membranbundet ABC-transporterkompleks for å transportere molekyler inn i bakteriell cytoplasma. Målet med prosjektet er å studere bindingsinteraksjonene og dynamikken til substratbindende proteiner og deres ABC-transportør. Studenten vil søke etter eksperimentelle strukturer av SBP-er og ABC-transportører og analysere i detalj de som ligner på Borrelia-proteinene, med sikte på å identifisere rester som er involvert i interaksjonene. Videre vil dynamikken i interaksjonen bli studert ved hjelp av molekylærdynamiske simuleringer.