A Borrelia burgdorferi BmpD egy szubsztrátkötő fehérje (SBP), amely egy membránhoz kötődő ABC-transzporter komplex segítségével szállít molekulákat a baktérium citoplazmájába. A projekt célja a szubsztrátkötő fehérjék és az ABC-transzporterük közötti kötődési kölcsönhatások és dinamika vizsgálata. A hallgató feladata az SBP-k és az ABC-transzporterek kísérleti szerkezetének felkutatása, valamint a Borrelia-fehérjékhez hasonló szerkezetek részletes elemzése, azzal a céllal, hogy azonosítsa az interakciókban részt vevő aminosavmaradványokat. Ezenkívül molekuláris dinamikai szimulációk segítségével tanulmányozná az interakciók dinamikáját.
A biotudományok terén a BSc vagy MSc képzés 3. évfolyamának megfelelő ismeretek, a fehérjeszerkezetekről szóló alapismeretek, valamint alapvető laboratóriumi gyakorlati ismeretek.