Kursens syfte: Översikt över nya CRISPR-baserade metoder för genomredigering och därav härledda tekniker.
Huvudämnen: CRISPR:s historia; Noggrannheten hos CRISPR/Cas9-baserad genomredigering och High Fidelity Cas9-varianter; RNA-riktade CRISPR-system; Anti-CRISPR-strategier; CRISPR-screeningar med hög genomströmning; CRISPR-baserade molekylära verktyg; Basredigerare; Användningen av CRISPR inom jordbruket; Användning av genomredigering på människor och de etiska aspekterna kring detta.
Denna kurs ger en fördjupad inblick i de banbrytande CRISPR-baserade teknikerna för genomredigering. Studenterna får följa CRISPR:s historia, från den första upptäckten av CRISPR-Cas9 i bakterier till dess utveckling till en mångsidig plattform för genomredigering.
Genom att fördjupa sig i CRISPR:s grunder får studenterna lära sig om de molekylära grunderna för målägenkänning hos komplexet bestående av Cas9-endonukleaset och guide-RNA, samt hur denna interaktion kan modifieras för att öka specificiteten. Studenterna kommer att studera Cas9-varianter med hög precision och lära sig om deras begränsningar. Kursen behandlar även alternativa CRISPR-system, såsom verktyg för RNA-målstyrning, samt anti-CRISPR-mekanismer som hämmar CRISPR-aktiviteten.
Utöver grunderna i CRISPR-Cas9 kommer studenterna att fördjupa sig i härledda tekniker. De kommer att undersöka CRISPR-screeningar med hög genomströmning för systematiska genetiska studier, samt CRISPR-baserade verktyg som basredigerare som möjliggör exakta förändringar av enstaka nukleotider.
Vi kommer även att undersöka tillämpningen av nya tekniker för genomredigering, bland annat inom jordbruket för att förbättra grödor och öka motståndskraften mot sjukdomar. Slutligen kommer studenterna också att reflektera över de etiska konsekvenserna av redigering av det mänskliga genomet, särskilt när det gäller terapeutiska tillämpningar och modifieringar av könslinjen.
När kursen är avslutad kommer studenterna att ha en djupgående förståelse för de grundläggande principerna, de senaste framstegen och de mångfacetterade tillämpningarna av CRISPR-baserad genomredigering. De kommer att ha de kunskaper som krävs för att kritiskt utvärdera de vetenskapliga, tekniska och samhälleliga konsekvenserna av detta banbrytande område.
En gedigen förståelse (på magisternivå) av grundläggande genetik och biokemi är en förutsättning. Studenterna förväntas dessutom kunna läsa och tolka vetenskapliga artiklar på engelska.
De artiklar som kommer att diskuteras under lektionerna kommer att delas ut i förväg via Canvas.
Bland de rekommenderade böckerna finns även följande:
Studenterna ska presentera och kritiskt tolka resultaten i några centrala artiklar inom CRISPR-området. Läraren kommer att övervaka och leda dessa diskussioner, ge relevant feedback till de som presenterar samt tillhandahålla mer detaljerad bakgrundsinformation vid behov.
Studieutdrag