Tá sé mar aidhm ag an gcúrsa léargas agus eolas praiticiúil a thabhairt ar mhodhanna íoslódála, láimhseála, próiseála agus léirshamhlaithe sonraí i dturgnaimh éagsúla ard-tréchur. Na topaicí is tábhachtaí sa chúrsa praiticiúil: (1) Réamhrá ar an timpeallacht ríomhaireachta, bash, agus bainistíocht sreabha oibre, (2) Réamhrá ar sheicheamhú an chéad ghlúin eile i gcoitinne, (3) Géanómaíocht, (4) Sliseanna-seicheamhú, (5) Tras-scríbhinníomaíocht (RNA-seicheamhú), (6) Anailís saibhrithe feidhmiúil, (7) Meitigéinómaíocht aimpliúcháin géine marcóra (16S rRNA), agus (8) Próitéomaíocht.
Is féidir an sceideal is déanaí, cur síos mionsonraithe, agus riachtanais a fháil anseo: https://docs.google.com/document/d/1z0–wXp5lenl1WI-p8CLCsZRuaJbkdgog1cmJpR7wlg/edit?usp=sharing
Ag deireadh an chúrsa, beidh an t-eolas seo ag an bhfoghlaimeoir:
Tá a fhios aige conas sonraí géineolaíochta agus próitéómaíochta ard-táirgeachta a phróiseáil.
Tuigeann sé na modhanna seicheamhaithe den chéad ghlúin eile, na sonraí, agus conas na “léamha” a phróiseáil i gcás seicheamhú géanómach, Chip-seq, RNA-seq, agus meitegéinómach rRNA 16S.
Tá eolas aige/aici ar réimsí feidhme modhanna taighde bitheolaíocha nua-aimseartha, tuigeann sé/sí an tábhacht a bhaineann le forbairt na modhanna seo, agus rannchuidíonn sé/sí leis an bhforbairt sin a oiread agus is féidir.
Tá eolas eolaíoch córasach aige.
Tá eolas aige/aici ar na naisc idir an t-eolas a fhaightear in ábhair éagsúla, agus tuigeann sé/sí an tábhacht a bhaineann le cur chuige idirdhisciplíneach.
Ag deireadh an chúrsa, beidh an foghlaimeoir in ann:
– tú féin a chur in iúl go gairmiúil, i bhfoirm ó bhéal agus i scríbhinn araon, i réimse na bithfhaisnéise, na géineolaíochta ard-tréchur, agus na próitéimeice.
– sonraí agus eolas a chórasú, agus iad a anailísiú agus a mheas de réir gnéithe eolaíocha.
– naisc idir eolas réimsí eolaíochta éagsúla a aithint agus a chomhtháthú.
Dearcadh:
Cloíonn le rialacha eitice taighde agus cuireann sé iallach ar dhaoine eile iad a leanúint.
Scaipeann sé/sí torthaí réimse na heolaíochta go gníomhach, foilsíonn sé/sí eolas go muiníneach fiú sna meáin, agus cosnaíonn sé/sí a sheasamh/a seasamh gairmiúil i gcoinne ionadaithe ó chur chuige eile agus ó bhréageolaíocht, más gá.
Oscailte do thorthaí nua taighde bitheolaíocha agus eolaíocha eile agus do chomhar eolaíoch. Lorgaíonn sé tuilleadh forbartha a dhéanamh ar thorthaí atá ann cheana féin agus cuireann sé forbairt treoracha taighde nua chun cinn go gníomhach.
Tiomanta d’obair ardchaighdeáin, leagann sé síos caighdeán ard maidir le heolas eolaíoch agus dul chun cinn é féin agus a chomhthaighdeoirí.
Neamhspleáchas agus freagracht:
Cuireann sé tuairimí in iúl ar shaincheisteanna bitheolaíochta, bithfhaisnéise agus modhanna ard-tréchuir go freagrach i gciorcail ghairmiúla agus neamhghairmiúla.
Coinníonn timpeallacht ríomhaireachta nua-aimseartha agus cuidíonn le hathnuachan leanúnach modheolaíoch agus teicneolaíoch chun oibriú chomh héifeachtach agus is féidir
Gráid sheachtainiúla
Gheobhaidh tú grád do d’obair go seachtainiúil. Is é meán na ngrád seachtainiúil leath do ghráid deiridh.
Féadfaidh mic léinn suas le 3 chleachtais a chailleadh. Ciallaíonn sé seo nach bhfaighidh tú grád don tseachtain sin, agus ní chuirfear san áireamh é i do ghrád deiridh.
Obair thionscadail don scrúdú
Caithfidh gach duine agaibh tacar sonraí OMICS a roghnú le hanailísiú ag baint úsáide as na modhanna a d'fhoghlaim sibh sa chúrsa. Mar sin, is féidir libh próitéomic, anailís SNP, anailís RNA-seq, anailís ChIP-seq, etc. a dhéanamh. Is fútsa atá sé cinneadh a dhéanamh faoin gcineál anailíse a dhéanfaidh sibh. Ná bíodh leisce ort teagmháil a dhéanamh leis na teagascóirí má theastaíonn cúnamh uait chun topaic nó tacar(anna) sonraí a roghnú. Má shocraíonn sibh cén tacar sonraí le húsáid agus cén anailísí le déanamh, scríobh 3-4 abairt anseo faoin dáta le socrú: Le socrú. Faoi dháta le socrú, cinnfidh na teagascóirí an bhfuil an topaic agus an tacar sonraí atá curtha chun cinn oiriúnach don obair tionscadail.
Ina dhiaidh sin, déanann tú an anailís leat féin. Cinntigh go bhfuil gach céim in-athchruthaithe trí chomhad loga nó tuarascáil a chruthú. Ullmhaigh cur i láthair 10 nóiméad le sleamhnáin a chuireann síos ar an tacar sonraí, an anailís, agus na torthaí. Seol an comhad loga nó an tuarascáil anailíse trí ríomhphost chuig na teagascóirí faoin dáta le socrú.
Cuir do chuid oibre i láthair na dteagascóirí agus do chomhghleacaithe ar dháta(í) le socrú le linn na hoibre praiticiúla. Féadfaidh na teagascóirí agus na comhghleacaithe ceisteanna a chur faoin anailís a chuir tú i láthair.
Tá an grád praiticiúil deiridh bunaithe ar do chuid oibre i rith an tseimeastair (50%) agus ar do chur i láthair (50%). Ní mór duit grád 2 ar a laghad a bhaint amach as d’obair sheimeastair iomlán agus as d’anailís agus do chur i láthair chun an cúrsa seo a chríochnú go rathúil.
Cuirfear litríocht, páipéir agus suíomhanna gréasáin molta ar fáil ag deireadh gach léachta.
Léachtaí, taispeántas, praiticiúil: obair aonair ar ríomhairí, cur i láthair na dtorthaí.
Tras-scríbhinn taifead