Tá sé mar aidhm ag an gcúrsa léargas agus eolas praiticiúil a thabhairt ar mhodhanna íoslódála, láimhseála, próiseála agus léirshamhlaithe sonraí i dturgnaimh éagsúla ard-táirgeachta. Na topaicí is tábhachtaí sa chúrsa praiticiúil: (1) Réamhrá don timpeallacht ríomhaireachta agus do bash, (2) Réamhrá do sheicheamhú an chéad ghlúin eile, (3) Géanómaíocht, (4) Sliseanna-seicheamhú, (5) Tras-scríbhinníomaíocht (RNA-seicheamhú), (6) Anailís saibhrithe feidhmiúil, (7) Meitigéinómaíocht aimpliú géine marcóra (16S rRNA), agus (8) Próitéomaíocht.
Is féidir an sceideal is déanaí, cur síos mionsonraithe agus riachtanais a fháil anseo: https://docs.google.com/document/d/1okHYnyxcyyCyohYHSyNDFSWE4sEnllHoQKyvVrJ2-Z0/edit?usp=sharing
Ag deireadh an chúrsa, beidh an t-eolas seo ag an bhfoghlaimeoir:
Tá a fhios aige conas sonraí géineolaíochta agus próitéimeice ard-táirgeachta a phróiseáil.
Tuigeann sé na modhanna seicheamhaithe den chéad ghlúin eile, na sonraí, agus conas na “léamha” a phróiseáil i gcás seicheamhú géanómach, Chip-seq, RNA-seq, agus meitegéinómach rRNA 16S.
Tá eolas aige/aici ar réimsí feidhme modhanna taighde bitheolaíocha nua-aimseartha, tuigeann sé/sí an tábhacht a bhaineann le forbairt na modhanna seo, agus rannchuidíonn sé/sí leis an bhforbairt sin a oiread agus is féidir.
Tá eolas eolaíoch córasach aige.
Tá eolas aige/aici ar na naisc idir an t-eolas a fhaightear in ábhair éagsúla, agus tuigeann sé/sí an tábhacht a bhaineann le cur chuige idirdhisciplíneach.
Ag deireadh an chúrsa, beidh an foghlaimeoir in ann:
In ann tú féin a chur in iúl go gairmiúil, i bhfoirm ó bhéal agus i scríbhinn araon i réimse na bithfhaisnéise, na géineolaíochta ard-tréchur agus na próitéimeice.
In ann sonraí agus eolas a chórasú, agus iad a anailísiú agus a mheas de réir gnéithe eolaíocha.
In ann naisc a aithint agus a chomhtháthú idir eolas réimsí eolaíochta éagsúla.
Dearcadh:
Cloíonn le rialacha eitice taighde agus cuireann iallach ar dhaoine eile iad a leanúint.
Scaipeann sé/sí torthaí réimse na heolaíochta go gníomhach, foilsíonn sé/sí eolas go muiníneach fiú sna meáin, agus cosnaíonn sé/sí a sheasamh/a seasamh gairmiúil i gcoinne ionadaithe ó chur chuige eile agus ó bhréageolaíocht, más gá.
Oscailte do thorthaí nua taighde bitheolaíocha agus eolaíocha eile agus do chomhar eolaíoch. Lorgaíonn sé tuilleadh forbartha a dhéanamh ar thorthaí atá ann cheana féin agus cuireann sé forbairt treoracha taighde nua chun cinn go gníomhach.
Tiomanta d’obair ardchaighdeáin, leagann sé síos caighdeán ard maidir le heolas eolaíoch agus dul chun cinn é féin agus a chomhthaighdeoirí.
Neamhspleáchas agus freagracht:
Cuireann sé tuairimí in iúl ar shaincheisteanna bitheolaíochta, bithfhaisnéise agus modhanna ard-tréchuir go freagrach i gciorcail ghairmiúla agus neamhghairmiúla.
…
Gráid sheachtainiúla: Gheobhaidh tú grád as do chuid oibre gach seachtain. Má bhí tú in ann do chuid oibre a chríochnú le linn na praitice gheobhaidh tú an grád seachtainiúil ansin. Mura raibh tú in ann do chuid oibre a chríochnú le linn na praitice, is féidir leat na réitigh agus an comhad loga a sheoladh trí ríomhphost chuig an léachtóir roimh dheireadh na seachtaine féin(!). Tar éis seachtain amháin a bheith caite ó bhí an praitic ann, beidh grád lúide a haon mar thoradh ar gach seachtain bhreise. (Mar shampla: má sheolann tú praitic lánréitithe 10 lá tar éis na praitice gheobhaidh tú grád 4 don obair sin.)
Mura chaill tú aon chleachtaí praiticiúla, is féidir leat uasmhéid de 11 ghrád seachtainiúil a bheith agat.
Is é meán na ngrád seachtainiúil leath do ghráid deiridh.
Cleachtadh a chailleadh: Is féidir le mic léinn MSc uasmhéid de 3 chleachtas a chailleadh. Ciallaíonn sé seo nach bhfaighidh tú grád don tseachtain sin, agus ní chuirfear san áireamh é i do ghrád deiridh.
An scrúdú: Caithfidh gach duine agaibh tacar sonraí a roghnú le hanailísiú ag baint úsáide as na modhanna a d'fhoghlaim sibh sa chúrsa. Mar sin, is féidir libh próitéomic, anailís SNP, anailís RNA-seq, anailís ChIP-seq, etc. a dhéanamh. Is fútsa atá sé cinneadh a dhéanamh faoin gcineál anailíse a dhéanfaidh sibh. Ná bíodh leisce ort teagmháil a dhéanamh linn má theastaíonn cúnamh uait chun topaic nó tacar(anna) sonraí a roghnú. Má shocraíonn sibh cén tacar sonraí le húsáid agus cén anailísí le déanamh, scríobh 3-4 abairt anseo faoi (dáta: Le socrú): (nasc chuig an doiciméad). Faoi (dáta: Le socrú), cinnfidh na léachtóirí an bhfuil an topaic agus an tacar sonraí atá curtha chun cinn oiriúnach don scrúdú.
Ina dhiaidh sin, déanann tú an anailís leat féin. Cinntigh go bhfuil gach céim in-athchruthaithe trí chomhad loga nó tuarascáil a chruthú. Ullmhaigh cur i láthair 10 nóiméad le sleamhnáin a chuireann síos ar an tacar sonraí, an anailís, agus na torthaí. Seol chugainn an comhad loga nó tuarascáil na hanailíse trí ríomhphost faoin (dáta: Le socrú).
Cuir do chuid oibre i láthair na léachtóirí agus na gcomhghleacaithe ar (dáta: le socrú) le linn na hoibre praiticiúla. Féadfaidh na léachtóirí agus na comhghleacaithe ceisteanna a chur faoin anailís a chuir tú i láthair.
Tá an grád praiticiúil deiridh bunaithe ar do chuid oibre i rith an tseimeastair (50%) agus ar do chur i láthair.
Cuirfear litríocht, páipéir agus suíomhanna gréasáin molta ar fáil ag deireadh gach léachta.
Obair aonair agus grúpa le linn na gcleachtadh praiticiúil ar ríomhairí.
Tras-scríbhinn taifead