I dette kurset vil studentene lære hvordan Linux/UNIX-operativsystemer fungerer, forstå fordelene og ulempene med disse systemene, og tilegne seg grunnleggende ferdigheter i programmering og utvikle grunnleggende programmeringslogikk.
Etter endt kurs vil studentene kunne kontrollere Linux/UNIX-systemer ved hjelp av kommandolinjeverktøy, kjøre programvare i kommandolinjen og løse bioinformatiske problemer fra kommandolinjen. Studentene vil også vite hvordan de kan nå eksterne servere på et nettverk, flytte filer mellom datamaskiner/servere og utføre kommandoer på en ekstern server som kjører et Linux/UNIX-operativsystem. Studentene vil kunne administrere og analysere data direkte ved hjelp av Linux-systemet, estimere ressursbehov for beregningsoppgaver og overvåke ressursbruken for disse oppgavene.
Studentene lærer å jobbe effektivt og hvordan de bruker ressursene på store servere ansvarlig. Det vil bli lagt vekt på passende arbeidsmoral: studentene lærer å overvåke ressursbruken på serveren sin og hvordan de bruker servere med flere brukere, uten å forstyrre andre brukere i arbeidet/forskningen deres.

Emner:
I. Grunnleggende om programmeringsspråket bash, grunnleggende kommandoer
II. Skrive bash-skript
III. Typer bash-variabler og bruken av dem; innebygde variabler
IV. Bash-betingelser, logiske operatorer
V. Programmeringslogikk I.
VI. Øvelse I.
VII. Bash-løkker og løkkekontroll
VIII. Kommandolinjeargumenter og bruken av dem i skript
IX. Programmeringslogikk II.
X. Øvelse II.
XI. Overvåking av ressursbruk, ressursforvaltning
XII. Bioinformatikeres ansvarlige arbeid på servere
+Prosjektarbeid som skal gjennomføres som selvstudium i grupper.

Evaluering
Studentene skal ta et kollokvium i løpet av eksamensperioden. Kollokviet vil bestå av to deler: en teoretisk prøve og en praktisk oppgave. Den teoretiske prøven kan inneholde både flervalgsoppgaver og essayoppgaver. Den praktiske oppgaven består av programmeringsoppgaver, som må løses av studentene selvstendig.